FungiSol : une nouvelle saison du projet de science participative à la découverte des champignons microscopiques

FungiSol, c’est quoi ?

Le projet FungiSol est un projet de science participative associant des enfants de cycle 3 (CM1-CM2), sur le thème de la biodiversité fongique du sol. Cette étude, réalisée au sein de la ville de Nantes, vise à améliorer nos connaissances sur la biodiversité fongique du sol et son impact potentiel sur la santé humaine, dans une perspective One Health.

L’objectif principal de ce projet est double : d’une part de mieux faire connaître l’importance des champignons microscopiques et la mycologie médicale grâce à une démarche de recherche participative et, d’autre part, d’apporter des données originales sur la biodiversité fongique du sol en milieu urbain, et en particulier la présence de levures potentiellement pathogènes pour l’Homme ou encore d’identifier de nouvelles espèces fongiques encore non décrites ce jour. Au total, huit écoles participeront sur deux années scolaires (2024-2025 et 2025-2026).
 

Une première année riche

Durant l'année 2024-2025, plus de 2 400 levures ont ainsi été isolées à partir de 191 échantillons de sols collectés au sein des établissement scolaires. Au total, ce sont 50 espèces distinctes appartenant à 27 genres différents, illustrant l’importante diversité du sol, qui ont été identifiées. Parmi ces levures cinq font partie de la liste des espèces prioritaires de l’OMS. Par ailleurs, ce travail a permis de mettre à jour plusieurs nouvelles espèces, en cours de description.

D’un point de vue pédagogique, le projet FungiSol a permis de mobiliser, de faire participer et de toucher différents publics : 
 

• Les enseignants de chacune des classes ayant collaboré au projet en l’intégrant dans le programme de sciences (cycle 3)
• Les élèves, âgés de 8 à 10 ans (95 au total durant l’année 2024-2025) ont découvert à travers ce projet l’importance des champignons microscopiques, la démarche scientifique, la rédaction d’un protocole expérimental pour effectuer des prélèvements de sol et ont suivi l’avancement du projet tout au long de l’année
• Les chercheurs et les étudiants de Nantes Université ont accueilli les classes lors des séances de prélèvements 
• Les parents des élèves ont été sensibilisés aux avancées du projet de recherche 
• Le grand public a été informé du projet grâce à la communication effectuée sur les réseaux sociaux, ainsi que la participation à des évènements scientifique grand public comme le forum des Sciences organisé par le Pôle Séquoia.

Pour chacune des classes, trois interventions se sont tenues en classe et une sortie sur un site de Nantes Université a été organisée avec en prime une visite de laboratoire. 
 

Quoi de neuf pour 2025-2026 ?

Le projet continu bien entendu à travers l’implication de quatre nouvelles écoles (Le Linot, Jonelière, Germaine Tillion et Bottière) ce qui permettra de compléter les résultats scientifiques, et de poursuivre le partenariat et la dynamique de sciences participatives mises en place. Par ailleurs l’obtention d’un appui de l’Agence Nationale de La Recherche (ANR) va permettre la réalisation d’analyses complémentaires (analyse métagénomique du sol et physicochimiques). Une malle pédagogique est en cours d’élaboration pour que des classes n’ayant pas participé au projet puisse profiter des activités et des contenus pédagogiques développés. Cette malle sera localisée à la mission Séquoia et une version numérique sera mise à disposition de tous sous forme de ressource libre sur la plateforme NEO de Nantes Université.
 

L’équipe du projet (2024-2026) 

• Dr Isabelle Ourliac-Garnier – Maitre de conférences UR1155 – IICiMed - UFR de Pharmacie Nantes Université – Porteur du projet
• Pr Florent Morio - PU-PH, UR1155 – IICiMed – UFR de Médecine Nantes Université - Co-porteur du projet pour la partie scientifique
• Elen Lepage - Médiatrice scientifique, Pôle Séquoia, Mairie de Nantes - Co-porteur du projet et Partenaire de la société civile dans le cadre de l’ANR
• Cécile Moisdon  - responsable du Pôle Séquoia  - Mairie de Nantes - Partenaire de la société civile dans le cadre de l'ANR
• Dr Rose-Anne Lavergne - MCU-PH, UR1155 – IICiMed – UFR de Médecine Nantes Université Accompagnement dans les classes et aide à l’analyse des échantillons
• Dr Catherine David - Maitre de conférences UE1155 – IICiMed – UFR de Pharmacie Nantes Université - Accompagnement dans les classes
• Marjorie Albassier - Assistant Ingénieur – UR1155 – IICiMed - Accompagnement dans les classes et aide à l’analyse des échantillons
• Emmy Colombet - Étudiante M2 Microbiologie (Université Claude Bernard, Lyon 1)
• Thomas Ferran - Étudiant M2 One Health (Oniris)
• Manon Cadeau - Interne en biologie médicale au CHU de Nantes